学校扣留初中毕业证的处理结果可能受以下特殊情况影响，需具体分析。
1. 学生因特殊原因未完成学业：若学生因重大疾病、家庭变故等不可抗力未完成毕业必备环节，学校可根据实际情况制定个性化补修方案，暂缓发放毕业证，但不得直接扣留，需与学生协商解决。
2. 学校收费项目不合法：若学校以未缴“赞助费”“补课费”等违规费用为由扣留毕业证，该扣留行为无效，学生可向教育部门投诉要求学校退还违规费用并发放毕业证。
3. 毕业证已补办但原证被扣留：若学生已通过教育部门补办毕业证，学校扣留原证的行为不影响其学历证明效力，但学生仍可要求学校返还原证。
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关于学校是否可以扣留学生初中毕业证的问题，需结合具体情况判断。
学校一般无权随意扣留学生初中毕业证，但存在法定或约定情形时除外。
1. 若学生已完成初中阶段全部学业要求（如通过所有课程考试、完成综合素质评价等），且无未缴清的法定费用，学校不得扣留毕业证，需依法发放。
2. 若学生未完成学业要求（如存在挂科未补考、未完成社会实践等毕业必备环节），学校可暂缓发放毕业证，待学生补全后再行发放。
3. 若学生未缴清学费、住宿费等学校依规收取的费用，学校可依据相关规定暂扣毕业证，直至费用缴清。
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针对学校扣留初中毕业证的合法性，可依据《中华人民共和国教育法》进行分析。
根据《中华人民共和国教育法》第四十三条第三项规定，受教育者“完成规定的学业后获得相应的学业证书、学位证书”是法定权利。若学生已完成初中阶段规定的学业（如通过毕业考试、满足学分要求），学校扣留毕业证则违反该条款，侵犯学生的学业证书获取权；若学生未完成学业（如未通过毕业考试）或未缴清依规收取的费用，学校暂缓发放毕业证属于对学业完成情况的合理审查，符合教育管理的必要性，未违反该条款。综上，学校扣留毕业证的合法性核心在于学生是否满足“完成规定学业”的法定条件。
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处理学校扣留初中毕业证问题时，需避免以下常见错误操作。
1. 直接与学校发生冲突：部分学生或家长因情绪激动与老师、校领导争吵，不仅无法解决问题，还可能激化矛盾，影响后续沟通的可能性。
2. 忽视证据收集：未及时保存学业完成证明、费用缴纳凭证等关键材料，导致维权时无法证明自己符合毕业条件，陷入被动。
3. 错过维权时效：未在知道权利被侵害后的三年内主张权利（如投诉或诉讼），可能因超过诉讼时效丧失胜诉权。
若您不确定自己是否存在错误操作，或需要补救建议，欢迎进一步向我们咨询，我们将帮您梳理维权思路。

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